PanGu五人组还剩四人，他们气急败坏立即联系杜长峰，将事情汇报，杜长峰利用职权制作一份假情报，误导时任基地最高领导古兴国，古兴国签署命令，责令基地空军前往玉天市安全所发动空.袭。
在这场空袭中，蒙先生和布雷亚侥幸脱逃，而Simon却葬身于此。蒙先生令布雷亚携带D病毒抗体U盘离开我国，自己则前往青洋市基地，伺机对PanGu四人及杜长峰发动报复行动。
空.袭中受到牵连的还有我的队伍，在漫天的炮火声中，雷羽被倒塌的石柱压死，苏柒被地下停车场的怪物咬死，狄岩和小雨失散，叶子被丧尸咬伤，为了让我和林月还有学长三人顺利逃走，她独自引开了空中的乌鸦群，最后也因此而死。
逃亡中，我体力不支倒下了，昏迷期间林月杀死了对她图谋不轨的学长，独自带着我逃亡。
在一家快捷酒店中，我身体恢复醒来后再没看见林月，只发现了林月纸条上的遗言，随后才在对面房间发现自锁在卫生间里的女孩。
一把大火烧尽了酒店，也烧尽我所有生的希望，在游荡中我再次遇到了久违的敖翔，趴在他的怀中嚎啕大哭。
被敖翔救下后，他队伍里的赵欣月照顾了我一阵，我醒来却像个生人勿进的刺猬，用言语和肢体伤害着每一个接近我的人。
离开的敖翔的队伍，我一个人奔着死的想法到处游荡，甚至一度站在高楼窗口，思考要不要跳下去，最终还是退缩了。
在阴暗人格崩溃的这段时间，另一层人格重新出来掌控了我的意识。为了生存，我偷食物抢饮水，为了一口粮食我可以卑贱到没有底线，直到我遇上了一只大黄狗，开始相互结伴。
随后我回到了当初队伍遭到空.袭的地方，独自一人面对咬死苏柒的那种长毛怪，费劲全力杀死了他，这一战让我重新拾回自信，以及生存下去的动力。
这段时间，敖翔和他的队伍到达了青洋市人类基地，其后不久便参加了基地搜索队，并且结识了基地天使郭雅，以及吴炳昊，并将吴收为助手。
青洋市人类基地遭遇尸群攻城，两座由内陆通往基地西部正门的跨河大桥，其中一座成为尸群主要到达基地城门下的通路，基地搜索队原队长意图.炸.毁大桥未遂而牺牲，敖翔吴炳昊两人冒死前往大桥将其.炸.毁，敖翔因此成为基地的英雄，流芳百里。
青洋市人类基地经此一役，时任最高领导古兴国离奇死亡，随后由其前秘书杜长峰接任基地领导，并未经BJ同意便擅自提升参谋长杨革平为少将，主管基地.军.务。PanGu五人组在杜长峰的支持下建立了秘密研究所，专项研究D病毒进化理论。
冥燕博士在青洋市基地继续研究D病毒抗体，而后发现有人利用她的研究非法研制D病毒进化事宜，并在各大医院暗中转移无名尸体进行人体实验，冥燕博士无法容忍这种丧尽天良的行为，盗取了一切有关抗体和进化的资料，逃出实验室。
逃亡中的冥燕博士找到了我的父亲石傲雄，将资料交托给他，自己再次逃走，却在逃亡中不幸死亡。
我爸得知了基地暗中的勾当，和同伴们一起建立了生命守卫联盟，暗中对抗杜长峰和PanGu组织，保护D病毒相关资料。
在玉天市，我和黄狗相依为命生活了一阵子，之后遇到了被人挟持的窦洋，救下她以后得知在玉天市南部有一个安全据点。和窦洋一起前往安全据点，玉天市海港家湾酒店。
到达酒店后我得知窦洋是据点领导人窦长生的孙女，借由这一层关系我在酒店得到了良好的休憩。
在这里我再次遇到了刘筱天和李晓雨，还有就是高小涵，得知他曾和彭妙一起逃到这里，但是后来彭妙坠楼身亡，原因定性为自杀。
在一路追查下，我们得知，因为彭妙知道一处秘密地点，是他丈夫雷羽当年藏匿枪支的武器库，酒店守卫队大队长欧阳羽为了得到这批武器，开始循循善诱希望彭妙能交待实情，但彭妙闭口不言，欧阳羽的弟弟欧阳德性情暴虐，强硬逼迫彭妙就范，最终导致彭妙跳楼身亡。
我被安排进了酒店的搜索队负责外出搜寻幸存者和食物的任务，意外得知，队中女孩时蕾和代号奥迪的维修工，两人的家都在山风市，曾经在结伴逃离山风时被丧尸围困在一个医院顶楼，后来有个傻小子在外面按响汽车喇叭引走一部分丧尸，这才帮助他们脱困，我直言那个傻小子就是我。有了这一层关系，大家又亲近了几分。
一次任务中，搜索队遭到重创，多名队员身亡，后来得知袭击我们的人是欧阳羽在外面培养的势力，目的就是要击溃搜索队，再内外夹攻酒店，以夺取窦长生的政权，如果放任不管，将来酒店就要成为欧阳兄弟的天下了。
我开始着手策划消灭欧阳兄弟的计划，搜索队逐渐依据我的安排开展行动，在我取得欧阳羽的信任后，我们发动了总攻，夺下了酒店控制权，杀死了欧阳兄弟，可惜刘筱天在行动中不幸身亡。
在此我还认识了小七的亲生弟弟，沈剑。
我和王威、杨世玉三人成为酒店新一届的领导人，窦长生和窦洋被直升机送往青洋市的人类基地。
经营酒店近一年后，我得知了父亲在青洋市人类基地出现的消息，并且和小七同样成为了通缉犯，于是我立刻着手准备前往青洋市。
准备出发的日子，青洋市派张玮兵连长前来抓我回去问话，他手下的兵也是曾经孟奇班长的士兵，因为孟奇死亡一事对我的态度由善转恶。我着人将张玮兵一众抓了起来，就在这时，丧夫心切的李晓雨对我扣下了扳机。
受伤的我被紧接处理后抬上直升机送往青洋市基地，途中飞机失事坠毁，我被男青年陆里桥和女孩石嘉倩救回了一个山林营地，醒来后发现自己已经失忆，陆里桥和石嘉倩为我取名石小七。
之后营地里遭到了丧尸袭击，逃离后的我们来到玉天东部都昌市的一个人类据点，在此我遇到了旧识刘淼，但已经不认得她了。
刘淼通过欺骗获取了我的信任，带我逃离据点，两个人找了一处平房区安顿下来，过了一段简单快乐的日子，随后刘淼良心发现，主动吐露当年发生的事情，最终因病而亡。
我再次踏上旅程，直奔青洋市人类基地。
到了基地之后，我在检疫所结识了同屋的九个弟兄，离开检疫所后，我和老八老十两个兄弟被安排在同一个住宅房内。此时我仍然没有恢复记忆，但基地中已经有多股势力发现我的到来，开始密切注意我的行动，为的是通过我找到我的父亲，得到他手中的一份有关病毒研究的秘密资料。